夏季巢湖盛行东南风，大量蓝藻就会集聚在巢湖北岸。相较往年，今年蓝藻产生情况基本未变，但入夏后巢湖水位创历史新高，受洪水、高温、面源污染等综合因素影响，巢湖蓝藻呈“抬头”态势。
  此次，面对洪水侵袭，环巢湖包河沿线，一方面，湖水没过蓝藻围堰，部分蓝藻、水草被冲进湖边防浪树林，原有围堰失去拦截守护功能；另一方面，2座藻水分离站、3座加压深井和24座打捞平台及外围管道、电源设备大部分被淹没破坏，失去蓝藻处置效用。因此，蓝藻防控形势尤为严峻。
  为应对巢湖蓝藻，无锡德林海环保科技股份有限公司还从滇池、洱海等处紧急抽调了多台加压控藻船、藻水分离船等设备设施。目前，人力打捞、机械打捞、管道输送“三位一体”，全面防控巢湖蓝藻，各相关单位部门，正全力以赴做好蓝藻的应急处置。经过抢修，塘西河、派河两大藻水分离站调峰池已正常投用，15000立方容量的调峰池可供藻浆、泥浆循环存储。